AFP金融理财师证书可以抵扣个税吗

可以，但是自己要提前申报。根据财政部、国家税务总局发布的《关于2018年第四季度个人所得税减除费用和税率适用问题的通知》，2018年10月1日至12月31日期间，纳税人实际取得的工资、薪金所得，减除费用(通常所说的“起征点”)统一按照5000元/月执行，并执行新的税率表。具体可自己登录个人所得税那个软件，针对自己的情况进行申报。