国内硕士生毕业之后想留学日本拿到博士学位，有可能吗

可以的，准备充分就可以。
国内如果获得了硕士学位的话去日本读博士可以申请直接进入博士后期课程。
具体的办法是找自己感兴趣专业的教授，直接写邮件或者电话联系，将你自己的情况，所学专业，今后的研究方向计划告知。如果对你的研究计划或者学术背景感兴趣，对方教授愿意接纳你读博，你就可以进行后续申请了。
具体手续你可以咨询愿意接纳你的导师，一般日本读博士也需要通过入学考试。这种入学考试无非是基础知识部分和专业知识部分，考博士生的试题一般由每个导师出题，所以只要导师愿意要你，考的范围肯定是你知道的，所以不用太过担心。
如果要在日本读博士，可以不懂日语，但是最好英语要好一点。因为日本人普遍英语的会话能力比较差，大学的教授也爱面子，有个英语好的留学生说明他英语水平也高。所以越是好学校的好导师，越是看中学生的英语能力。所以如果你的英语还自觉过得去的话，建议尽量争取联系好的国立大学的教授，这样一旦被录取，有助于你将来的毕业，就职。
当然，专业知识也是十分重要的，这是你学习，就业的基础，也可能关系到申请奖学金的机会。
如果教授愿意要你，参加博士生入学考试有两种方法，一种是直接考试，到时间直接进行考试，通过后就是正式学生。还有一种先申请日本大学的“研究生”，和国内不同的是日本的所谓研究生不是国内的读学位的课程，而是为了参加入学考试，先到导师的研究室熟悉情况带准备考试。如果不是时间很紧的话建议采用后一种方式。可以充分熟悉环境，有利于后面的学习生涯。

如果在国内没有取得硕士学位，那就要通过日本的博士前期课程（又叫修士课程，相当于国内硕士）的入学考试，那就是统考了，难度相对来说要比博士后期课程的入学考要难。所以建议获得硕士学位后再去比较好。